Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC27A3Q5K4L6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC27A3Q5K4L6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms