Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLPPQ16740 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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