Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIX1Q15475 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms