Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NECTIN1Q15223 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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