Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPNMBQ14956 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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