Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NFIXQ14938 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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