Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL4Q14135 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL4Q14135 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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