Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF5Q13568 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF5Q13568 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms