Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4BQ07343 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms