Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A3Q01959 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SLC6A3Q01959 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms