Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIPPLY3P57055 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms