Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CD34P28906 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD34P28906 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD34P28906 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD34P28906 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms