Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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