Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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