Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGPD2P0DJD1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGPD2P0DJD1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms