Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1AO95602 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms