Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA2O43364 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms