Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms