Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F3O00716 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms