Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF22A3QJZ6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms