Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAMTA1Q9Y6Y1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms