Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC5Q9UQL6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms