Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNRF3Q9ULT6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms