Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FBXO4Q9UKT5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FBXO4Q9UKT5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms