Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5BQ9UGL1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms