Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ASF1BQ9NVP2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms