Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CIPCQ9C0C6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms