Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms