Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SHANK3Q9BYB0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms