Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARID3AQ99856 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARID3AQ99856 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms