Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMD1Q99460 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms