Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC4A9Q96Q91 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms