Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SCMH1Q96GD3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms