Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMO7Q8WWI1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMO7Q8WWI1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms