Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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FAT3Q8TDW7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
FAT3Q8TDW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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