Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TSSK4Q6SA08 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms