Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AGAP9Q5VTM2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms