Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RSPH4AQ5TD94 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH4AQ5TD94 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms