Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTCH1Q13635 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTCH1Q13635 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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