Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CUL4AQ13619 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CUL4AQ13619 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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