Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TROQ12816 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TROQ12816 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TROQ12816 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TROQ12816 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TROQ12816 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TROQ12816 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TROQ12816 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
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