Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD47Q08722 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD47Q08722 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms