Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SCN7AQ01118 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCN7AQ01118 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms