Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1BQ00975 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms