Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOBEC1P41238 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC1P41238 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms