Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TGFBR1P36897 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms