Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCC1P33527 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCC1P33527 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms