Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POLD1P28340 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POLD1P28340 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLD1P28340 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLD1P28340 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms