Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2AP24928 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms