Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRAP18433 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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